MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rahnella aquatilis CIP 78.65 = ATCC 33071 chromosome

Total Repeats: 98960

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016818	ATG	2	6	122	127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016818	T	6	6	151	156	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016818	CAG	2	6	157	162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016818	TGA	2	6	165	170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016818	TGC	2	6	221	226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187967
6	NC_016818	GGA	2	6	261	266	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383187967
7	NC_016818	CGC	2	6	366	371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187967
8	NC_016818	GTG	2	6	379	384	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187967
9	NC_016818	A	6	6	436	441	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016818	CTTTT	2	10	452	461	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016818	T	6	6	458	463	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016818	CCG	2	6	484	489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187968
13	NC_016818	GCA	2	6	506	511	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187968
14	NC_016818	GCTT	2	8	670	677	0 %	50 %	25 %	25 %	383187968
15	NC_016818	TGC	2	6	706	711	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187968
16	NC_016818	GCA	2	6	724	729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187968
17	NC_016818	GTCA	2	8	747	754	25 %	25 %	25 %	25 %	383187968
18	NC_016818	CAGC	2	8	763	770	25 %	0 %	25 %	50 %	383187968
19	NC_016818	CTATC	2	10	852	861	20 %	40 %	0 %	40 %	383187968
20	NC_016818	CG	3	6	927	932	0 %	0 %	50 %	50 %	383187968
21	NC_016818	GCG	3	9	930	938	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187968
22	NC_016818	TGG	2	6	989	994	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187968
23	NC_016818	TGCA	2	8	1021	1028	25 %	25 %	25 %	25 %	383187968
24	NC_016818	CAT	2	6	1040	1045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187968
25	NC_016818	GC	3	6	1047	1052	0 %	0 %	50 %	50 %	383187968
26	NC_016818	GTG	2	6	1068	1073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187968
27	NC_016818	AAC	2	6	1122	1127	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187968
28	NC_016818	TAC	2	6	1149	1154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187968
29	NC_016818	TAA	2	6	1199	1204	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187968
30	NC_016818	GAA	2	6	1218	1223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187968
31	NC_016818	TTC	2	6	1224	1229	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187968
32	NC_016818	CTG	2	6	1245	1250	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187968
33	NC_016818	CAG	2	6	1260	1265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187968
34	NC_016818	ATC	2	6	1266	1271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187968
35	NC_016818	GCC	2	6	1361	1366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187968
36	NC_016818	TGA	2	6	1393	1398	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187968
37	NC_016818	CTT	2	6	1442	1447	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187968
38	NC_016818	GCCAAC	2	12	1509	1520	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	383187968
39	NC_016818	TTCG	2	8	1548	1555	0 %	50 %	25 %	25 %	383187968
40	NC_016818	ATA	2	6	1606	1611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	383187968
41	NC_016818	GCCC	2	8	1686	1693	0 %	0 %	25 %	75 %	383187968
42	NC_016818	GATGGC	2	12	1700	1711	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	383187968
43	NC_016818	ACCA	2	8	1728	1735	50 %	0 %	0 %	50 %	383187968
44	NC_016818	GGT	2	6	1764	1769	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187968
45	NC_016818	GAA	2	6	1821	1826	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187968
46	NC_016818	AGA	2	6	1841	1846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187968
47	NC_016818	TTG	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187969
48	NC_016818	GAC	2	6	1952	1957	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187969
49	NC_016818	TTA	2	6	1984	1989	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187969
50	NC_016818	GC	3	6	2003	2008	0 %	0 %	50 %	50 %	383187969
51	NC_016818	TGG	2	6	2042	2047	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187969
52	NC_016818	CCA	2	6	2084	2089	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187969
53	NC_016818	CGA	2	6	2241	2246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187969
54	NC_016818	CGTT	2	8	2334	2341	0 %	50 %	25 %	25 %	383187969
55	NC_016818	ATT	2	6	2342	2347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187969
56	NC_016818	CGAC	2	8	2396	2403	25 %	0 %	25 %	50 %	383187969
57	NC_016818	TG	3	6	2418	2423	0 %	50 %	50 %	0 %	383187969
58	NC_016818	GCT	2	6	2499	2504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187969
59	NC_016818	CGG	2	6	2508	2513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187969
60	NC_016818	GCA	2	6	2540	2545	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187969
61	NC_016818	CGC	2	6	2617	2622	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187969
62	NC_016818	GCGT	2	8	2723	2730	0 %	25 %	50 %	25 %	383187969
63	NC_016818	GAA	2	6	2782	2787	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187969
64	NC_016818	AGA	2	6	2790	2795	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187969
65	NC_016818	TCT	2	6	2895	2900	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187969
66	NC_016818	TGC	2	6	2937	2942	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187969
67	NC_016818	GCG	2	6	2953	2958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187969
68	NC_016818	GGC	2	6	3039	3044	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187970
69	NC_016818	GGTC	2	8	3078	3085	0 %	25 %	50 %	25 %	383187970
70	NC_016818	CGG	2	6	3222	3227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187970
71	NC_016818	TGC	2	6	3329	3334	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187970
72	NC_016818	CGG	2	6	3391	3396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187970
73	NC_016818	GTT	2	6	3413	3418	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187970
74	NC_016818	TCA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187970
75	NC_016818	T	7	7	3435	3441	0 %	100 %	0 %	0 %	383187970
76	NC_016818	AGC	2	6	3473	3478	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187970
77	NC_016818	CGC	2	6	3483	3488	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187970
78	NC_016818	GC	3	6	3617	3622	0 %	0 %	50 %	50 %	383187970
79	NC_016818	TTTC	2	8	3650	3657	0 %	75 %	0 %	25 %	383187970
80	NC_016818	TG	3	6	3830	3835	0 %	50 %	50 %	0 %	383187970
81	NC_016818	GCGG	2	8	3875	3882	0 %	0 %	75 %	25 %	383187970
82	NC_016818	TCT	2	6	3894	3899	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187970
83	NC_016818	CCGA	2	8	3926	3933	25 %	0 %	25 %	50 %	383187970
84	NC_016818	ATG	2	6	4015	4020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187970
85	NC_016818	CTC	2	6	4120	4125	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	383187971
86	NC_016818	CAC	2	6	4211	4216	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187971
87	NC_016818	CGA	2	6	4246	4251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187971
88	NC_016818	GAT	2	6	4319	4324	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187971
89	NC_016818	GAA	2	6	4352	4357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187971
90	NC_016818	CTG	2	6	4368	4373	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
91	NC_016818	TCA	2	6	4380	4385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187971
92	NC_016818	TTC	2	6	4392	4397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187971
93	NC_016818	CGA	2	6	4414	4419	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187971
94	NC_016818	CGG	2	6	4438	4443	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187971
95	NC_016818	CGT	2	6	4465	4470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
96	NC_016818	CCG	2	6	4504	4509	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187971
97	NC_016818	CAC	2	6	4594	4599	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187971
98	NC_016818	CTG	2	6	4715	4720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
99	NC_016818	AACAAA	2	12	4790	4801	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	383187971
100	NC_016818	GTTGC	2	10	4862	4871	0 %	40 %	40 %	20 %	383187971
101	NC_016818	ATG	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187971
102	NC_016818	CAA	2	6	4912	4917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187971
103	NC_016818	AAG	2	6	4998	5003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187971
104	NC_016818	TGT	2	6	5065	5070	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187971
105	NC_016818	TCT	2	6	5126	5131	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187971
106	NC_016818	TGA	2	6	5157	5162	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187971
107	NC_016818	TGG	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187971
108	NC_016818	ATC	2	6	5225	5230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187971
109	NC_016818	TGC	2	6	5233	5238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
110	NC_016818	GC	4	8	5237	5244	0 %	0 %	50 %	50 %	383187971
111	NC_016818	CCG	2	6	5278	5283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187971
112	NC_016818	CTGG	2	8	5300	5307	0 %	25 %	50 %	25 %	383187971
113	NC_016818	GCGG	2	8	5384	5391	0 %	0 %	75 %	25 %	383187971
114	NC_016818	CCGTAA	2	12	5407	5418	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	383187971
115	NC_016818	GC	3	6	5468	5473	0 %	0 %	50 %	50 %	383187971
116	NC_016818	CT	3	6	5486	5491	0 %	50 %	0 %	50 %	383187971
117	NC_016818	CAT	4	12	5578	5589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187971
118	NC_016818	CA	3	6	5613	5618	50 %	0 %	0 %	50 %	383187971
119	NC_016818	TCT	2	6	5640	5645	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	383187971
120	NC_016818	GCC	2	6	5695	5700	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187971
121	NC_016818	A	6	6	5714	5719	100 %	0 %	0 %	0 %	383187971
122	NC_016818	CGT	2	6	5897	5902	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
123	NC_016818	GCT	2	6	5914	5919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
124	NC_016818	AAC	2	6	5921	5926	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187971
125	NC_016818	TGGA	2	8	5987	5994	25 %	25 %	50 %	0 %	383187971
126	NC_016818	CG	3	6	6004	6009	0 %	0 %	50 %	50 %	383187971
127	NC_016818	AGC	2	6	6024	6029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187971
128	NC_016818	CGTG	2	8	6052	6059	0 %	25 %	50 %	25 %	383187971
129	NC_016818	GAA	2	6	6206	6211	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	383187971
130	NC_016818	GTG	2	6	6228	6233	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187971
131	NC_016818	CGT	2	6	6293	6298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
132	NC_016818	ACC	2	6	6359	6364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187971
133	NC_016818	AAC	2	6	6375	6380	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	383187971
134	NC_016818	TGC	2	6	6415	6420	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187971
135	NC_016818	GTT	2	6	6427	6432	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	383187971
136	NC_016818	CAC	2	6	6433	6438	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187971
137	NC_016818	CCGCG	2	10	6461	6470	0 %	0 %	40 %	60 %	383187971
138	NC_016818	GGC	2	6	6533	6538	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016818	T	8	8	6580	6587	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016818	GC	3	6	6594	6599	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016818	GGCT	2	8	6610	6617	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016818	AATT	2	8	6684	6691	50 %	50 %	0 %	0 %	383187972
143	NC_016818	ATGG	2	8	6701	6708	25 %	25 %	50 %	0 %	383187972
144	NC_016818	GCA	2	6	6724	6729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187972
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146	NC_016818	CAG	2	6	6851	6856	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187972
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148	NC_016818	CAC	2	6	7066	7071	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	383187972
149	NC_016818	TGA	3	9	7134	7142	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187972
150	NC_016818	TGA	2	6	7144	7149	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187972
151	NC_016818	CTG	2	6	7157	7162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187972
152	NC_016818	CGG	2	6	7185	7190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	383187972
153	NC_016818	CAT	2	6	7210	7215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187972
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156	NC_016818	TGA	2	6	7317	7322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	383187972
157	NC_016818	GAG	2	6	7499	7504	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016818	CAGT	2	8	7583	7590	25 %	25 %	25 %	25 %	383187973
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163	NC_016818	CCG	2	6	7885	7890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	383187973
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165	NC_016818	CAT	2	6	8049	8054	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	383187973
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169	NC_016818	GTG	2	6	8268	8273	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	383187973
170	NC_016818	CTGC	2	8	8343	8350	0 %	25 %	25 %	50 %	383187973
171	NC_016818	GC	3	6	8426	8431	0 %	0 %	50 %	50 %	383187973
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178	NC_016818	GTC	2	6	8859	8864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	383187974
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193	NC_016818	TCTG	2	8	9340	9347	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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195	NC_016818	T	6	6	9414	9419	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_016818	T	6	6	9421	9426	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
197	NC_016818	ACG	2	6	9466	9471	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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245	NC_016818	TGA	2	6	11936	11941	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
246	NC_016818	CCA	2	6	11942	11947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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248	NC_016818	ACC	2	6	11977	11982	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
249	NC_016818	AGC	2	6	11992	11997	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
250	NC_016818	GAAT	2	8	12031	12038	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
251	NC_016818	TAT	2	6	12067	12072	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_016818	TAA	2	6	12092	12097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
253	NC_016818	ATT	2	6	12133	12138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_016818	T	6	6	12137	12142	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_016818	AT	3	6	12146	12151	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_016818	TAATG	2	10	12161	12170	40 %	40 %	20 %	0 %	383187979
257	NC_016818	ATT	2	6	12183	12188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187979
258	NC_016818	GGCG	2	8	12203	12210	0 %	0 %	75 %	25 %	383187979
259	NC_016818	GAG	2	6	12211	12216	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	383187979
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261	NC_016818	GCA	2	6	12253	12258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	383187979
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263	NC_016818	ATT	3	9	12366	12374	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	383187979
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